我国现有牡丹品种多达500多种，分为单瓣类、重瓣类、抬阁类三大类和红花系、粉花系、紫花系、白花系、黄花系等色系。虽然牡丹花的品种很多，由于牡丹是肉质根怕水涝、怕炎热等特性，因此不是所有的品种都可以用作盆栽。家庭盆栽牡丹宜选择那些适应性强、花期早、花型较好的洛阳红、二乔、赵粉等芍药根接苗作为盆栽品种，植株选用芍药作砧木嫁接的3年生小棵牡丹或具有3—5根枝干的分株苗。
